Natural de Bruselas, en Bélgica, José Miguel Gaona procede de una familia de españoles exiliados a causa del franquismo debido a la carrera de su abuelo como capitán de la Segunda República. Por ello, la familia vivió varios años en Chile, donde se relacionaron con el poeta Pablo Neruda, el periodista Augusto Olivares y los dirigentes Salvador Allende y Augusto Pinochet. Así, Gaona contó con un pasaporte oficial de apátrida hasta los doce años, cuando la familia pudo regresar a España.

Al volver a España, José Miguel se licenció en Medicina por la Universidad de Córdoba y, posteriormente, se doctoró en psiquiatría y realizó un máster en psicología médica en la Universidad Complutense de Madrid. Además, estudió Teología en la Universidad de Harvard. Como médico, Gaona ejerció cirugía cardiovascular en la Universidad de Gotinga, en Alemania, y como médico de salud mental en la ONG Médicos del Mundo durante la Guerra de Bosnia y el genocidio de Ruanda.

Asimismo, participó en la introducción de las primeras pruebas de VIH en España, en 1985, con ayuda del premio Nobel de Medicina Luc Montagnier. Además, abrió el primer centro destinado a su tratamiento que, sin embargo, fue clausurado por la Policía Nacional.

Como divulgador, Gaona comenzó su trayectoria en los medios de comunicación en la década del 2000 participando en programas como Cuarto Milenio (2005 hasta la actualidad) y Horizonte (2020 hasta la actualidad), en Cuatro, ambos conducidos por Iker Jiménez; Día a día (2004), El programa de Ana Rosa (2005 hasta la actualidad), El gran debate (2009-2011), Abre los ojos y mira (2013) y Al otro lado (2013) en Telecinco; Desde dentro (2004), en Telemadrid; Enfoque (2005), Espacio en Blanco (2010-2012), Para todos La 2 (2012) y La observadora (2015) todos en La 2 de TVE; 360 grados (2007), en EITB; y Caso Cerrado (2019), emitido en Telemundo.

En cuanto a su participación en programas de radio, sobresalen Milenio 3, (2005), en Cadena SER, Herrera en la Onda (2012-2015) y La rosa de los vientos (2012), en Onda Cero y Fin de Semana (2020 hasta la actualidad), en COPE.

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