Juan Carlos Unzué es conocido por ser uno de los porteros y, posteriormente, entrenador de porteros y segundo entrenador del F.C. Barcelona. También entrenó al Numancia y al Girona en Segunda División, mientras que fue entrenador del Celta de Vigo en Primera División. 

En su etapa como portero jugó en varios equipos, también de Primera División. Tras pasar dos temporadas como guardameta en el Osasuna, fichó como portero suplente de Zubizarreta en el F.C. Barcelona, para después terminar su carrera en el Sevilla, donde jugó más de 200 partidos.

Su final deportivo llegó en el año 2020, cuando decidió alejarse de los campos de fútbol, ya que fue diagnosticado de esclerosis lateral amiotrófica (ELA), momento en el que se convirtió en activista, centrado en investigar más sobre esta enfermedad.

Investigación y recaudación de fondos contra el ELA

Ejemplo de ello fue el saque de honor que realizó en un partido benéfico contra la ELA, que enfrentó al F.C. Barcelona y al Manchester City en el Camp Nou, y donde pidió que "se desbloquee y se tramite ya la ley de la ELA". 

Igualmente, está presente en otros muchos eventos realizados para la recaudación de fondos destinados a la lucha contra el ELA, como un torneo solidario de golf al que acudieron Pep Morata, Joan Laporta o Alex Corretja, entre otros.

Actualmente, sigue ligado al mundo del deporte, ya que se ha convertido en uno de los comentaristas de fútbol en la plataforma de DAZN, un puesto que ejerce desde el pasado año 2022.