Entre otras funciones a la Comisión de Control le corresponde el análisis de la gestión económica y financiera de la Entidad, elevando a la Comunidad Autónoma y a la Asamblea General información semestral sobre la misma, el estudio del balance y las cuentas de resultados que resuma la gestión del ejercicio y la consiguiente elevación a la Asamblea General del informe que refleje el examen realizado.

También, según informa la entidad en nota de prensa, la Comisión de Control debe informar a la Asamblea General sobre la gestión del presupuesto de la Obra Social, sobre los presupuestos aprobados por el Consejo de Administración y sobre la liquidación de los mismos, así como vigilar el cumplimiento de las inversiones y gastos previstos.