No fue hasta dos días después cuando la Guardia Civil inició el análisis de la mercancia y se dio cuenta de que uno de los paquetes estaba desprecintado y faltaban al menos cinco pistolas.

Fuentes próximas a la investigación explicaron su convencimiento de que el robo se produjo en Alemania antes de que las armas fueran empaquetadas, o bien durante el vuelo.

Las mismas fuentes aseguraron a Efe que es casi «imposible» que las armas fueran robadas en Barcelona, ya que, cuando el cargamento llegó al Prat, fue custodiado y trasladado en un camión blindado por una empresa de seguridad que lo trasladó a una cámara acorazada en un almacén del aeropuerto. Allí estuvo el arsenal incompleto hasta que se analizó dos días más tarde.