Su primer destino fue el Juzgado de Primera Instancia e Instrucción único de Infiesto (Asturias). Dos años más tarde fue promovida a la categoría de Magistrada y destinada al Juzgado de Primera Instancia e Instrucción nº 6 de Logroño, siendo en aquel momento la Magistrada más joven de España. En 2006, Isabel González se hizo cargo del Juzgado de lo Penal número 2 de la capital riojana, donde ejerció hasta agosto de 2015.

A lo largo de su trayectoria profesional Isabel González asumió el cargo de Decana de los juzgados del partido judicial de Logroño durante 13 años. Para ello fue elegida de forma unánime por sus compañeros jueces en el año 1997. Mientras fue Decana asumió activamente la defensa de la imagen de la Justicia en La Rioja, veló por el funcionamiento de una justicia digna y de calidad, por los intereses del justiciable y del ciudadano, y por el ejercicio independiente y respetuoso tanto de la labor jurisdiccional de sus compañeros jueces y magistrados, como de todos y cada uno de los colectivos de la Administración de Justicia riojana.

El 25 de enero de 2018 se le concedió la Cruz de San Raimundo de Peñafort por el Ministerio de Justicia. En 2008 Isabel González ingresó en la Orden al Mérito Policial, al haberle sido concedida por el Ministro del Interior la Cruz con Distintivo Blanco como reconocimiento a su trayectoria profesional.