Los cambios contemplan que todos los miembros de la Academia votarán a todas la categorías de premios, es decir a todas las especialidades. Las votaciones se realizarán en dos rondas: en la primera se elegirán cuatro nominaciones por cada premio; en la segunda, se vota una de las cuatro.

En seis ediciones de las 20 celebradas de los Premios Goya, los miembros votaban por especialidades. Cada uno de ellos votaba cuatro candidaturas de su misma especialidad, salvo Mejor Película, Película Europea, Extranjera de Habla Hispana, Documental y de Animación. Este sistema afectaba sólo a la primera ronda de votaciones, ya que en la segunda vuelta los académicos votaban a todos los nominados resultantes de la primera votación.

La decisión de someter a votación posibles cambios en el sistema vigente proviene de la Asamblea General Ordinaria celebrada el 12 de junio de 2005, en la que se acordó, por mayoría de votos, someter a referéndum el sistema de votación debiéndola realizar dentro del primer semestre del presente año.

Nuevos cargos directivos

Así mismo, se han renovado, mediante votación, el 50% de los vocales de la Junta Directiva para el siguiente periodo (2006/2012), siendo los más votados Alejandro Amenábar, Félix Murcia,  Emiliano Otegui, Ivonne Blake, Reyes Abades,  Pedro Eugenio Delgado, Tomas Pladevall, Agustín Díaz Yanes, Fernando Chinarro, Gregorio Ros, Guillermo Sánchez Maldonado, Roque Baños, Fernando Bovaira y José María Bloch.

En el caso de aceptar el cargo, todos ellos formarán la Junta Directiva junto a los que ocupan, desde el año 2003, el cargo en el que está previsto continúen hasta el 2009.

La actual Presidencia está compuesta por Mercedes Sampietro (presidenta), David Trueba y Montxo Armendáriz (vicepresidentes); los ex presidentes Antonio Gimenez-Rico, Fernando Trueba, Gerardo Herrero, José Luis Borau, Aitana Sánchez-Gijón y Marisa Paredes; el presidente de Honor, Luis García Berlanga y la directora general, Ana Arrieta.