El sorteo de la UEFA distribuyó a cuarenta equipos en ocho grupos de cinco equipos cada uno. Cada conjunto jugará cuatro partidos, dos en casa y dos fuera.
Se clasifican los tres primeros de cada grupo. En los dieciseisavos de final, los primeros clasificados jugarán contra los terceros, mientras que los segundos se medirán a los ocho equipos que salgan rebotados de la Liga de campeones.
| GRUPO A |
| AZ Alkmaar |
| Zenit |
| Everton |
| Nuremberg |
| Larissa |
| GRUPO B |
| Panathinaikos |
| Lokomotiv de Moscú |
| Atlético de Madrid |
| Copenhague |
| Aberdeen |
GRUPO C
|
| Villareal |
| AEK de Atenas |
| Fiorentina |
| Mlada Boleslav |
| Elfsborg |
| GRUPO D |
| Basilea |
| Hamburgo |
| Rennes |
| Dinamo Zagreb |
| Brann |
| GRUPO E |
Bayer Leverkusen
|
| Sparta de Praga |
| Spartak de Moscú |
| Toulouse |
| Zúrich |
| GRUPO F |
| Bayern Múnich |
| Bolton |
| Braga |
| Estrella Roja |
| Aris Salónica |
GRUPO G
|
| Anderlecht |
| Tottenham |
| Getafe |
| Happoel Tel-Aviv |
| Aalborg |
| GRUPO H |
| Girondins Burdeos |
| Austria Viena |
| Galatasaray |
| Panionios |
| Helsingborg |
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