El musclo obstrueix les canonades de captació d’aigua de les centrals, inutilitzant-les. Per acabar amb aquest problema, la companyia està començant a usar un producte «ambientalment amigable», tal i com el denomina l’empresa, a les canonades de captació d’aigua i als circuits interiors de les centrals del grup. Les investigacions per eradicar el musclo zebrat de les seves aigues ha costat a la companyia fins a la data una inversió de més de 450.000 euros. De fet, Endesa compta amb l’únic centre d’investigació específic d’aquesta espècie invasora i participa a cursos i conferències.